Amador war ein bisweilen überaus harter Verteidiger, der in den neun Spielzeiten zwischen 1979/80 und 1987/88 insgesamt elfmal des Feldes verwiesen wurde.[2] Im selben Zeitraum erzielte er zwei Tore: Sein erstes Tor, sein einziges in einem Punktspiel, gelang ihm in der Saison 1983/84 beim 4:1-Sieg der Pumas gegen Deportivo Toluca. In der darauffolgenden Saison traf er im Halbfinalhinspiel der Liguilla beim Club León (3:3).[3]
Von 1983 bis 1986 kam Amador Flores insgesamt 30 Mal für die mexikanische Fußballnationalmannschaft zum Einsatz. Höhepunkt seiner Nationalmannschaftskarriere war die Teilnahme an der im eigenen Land ausgetragenen Fußball-Weltmeisterschaft 1986, bei der er im letzten Vorrundenspiel gegen den Irak (1:0), im Achtelfinale gegen Bulgarien (2:0) und im Viertelfinale gegen Deutschland (0:0 n. V., 1:4 im Elfmeterschießen) zum Einsatz kam. Beachtenswert ist, dass „el Tri“, wie die Nationalmannschaft in Mexiko genannt wird, in den WM-Spielen, an denen er teilnahm, keinen einzigen Gegentreffer hinnehmen musste. Das Spiel gegen die deutsche Mannschaft war zugleich sein Abschiedsspiel für „el Tri“.
Trainer
In den Jahren 1999 und 2000 trainierte er ein Jahr lang die Profimannschaft der UNAM Pumas.[4]
Tod
Rafael Amador erlag am 31. Juli 2018 einer Krebserkrankung.[5]