Presenchen wurde im Jahr 1479 erstmals urkundlich erwähnt.[2] Der niedersorbische Name Brjazynka bedeutet das kleine Birkenwäldchen.
Das Gebiet um den Ort wurde bereits um das Jahr 850 von den Lusitzi, einem slawischen Volksstamm aus der Niederlausitz bewohnt. Aus dieser Zeit befand sich südlich des Ortes der slawische BurgwallBorchelt, der auf einer Talsandinsel im Sumpfgebiet entstand.
Der Ort Presenchen war im Jahr 1589 nachweislich im Besitz des Herrn von Mickwitz und gehörte ab 1667 als Vorwerk zur Standesherrschaft Drehna. Von 1921 bis zu dessen Enteignung im Jahr 1946 gehörte das Dorf Karl von Wätjen.
In Presenchen gab es eine Freiwillige Feuerwehr und einen Kindergarten, welcher im ehemaligen Gasthaus zur Linde untergebracht war. Die nächste Schule befand sich in Schlabendorf. Zudem hatte Presenchen keine eigene Kirche.[3]
Am 1. Juli 1950 wurde Presenchen nach Schlabendorf am See eingemeindet.[4] In den Jahren 1987/88 wurde Presenchen zugunsten des Braunkohletagebaus Schlabendorf-Süd vollständig abgebaggert. Seit 2004 erinnert das Naturparkzentrum Wanninchen mit einer Dauerausstellung an die abgebrochenen Orte in der Umgebung.[5]