Herman Moll: A Plan of Port Royal-Harbour in Carolina, 1736
1514 wurde Pedro de Salazar von Lucas de Allyon von Hispaniola aus geschickt, um die Küsten Amerikas zu erforschen. Dabei landete er in der Nähe von Port Royal. 1525 schickte Spanien eine weitere Expedition in dieses Gebiet, um eine Festung zu errichten.
1562 landete eine Gruppe französischerHugenotten unter Jean Ribault in der Region und gründete eine Festung namens Charles Forte. Drei Jahre später wurde die Siedlung von einer spanischen Schwadron aufgelöst. Ab 1710 besiedelten Briten die Gegend. Am 27. August 1893 verwüstete ein Hurrikan, der Sea Islands Hurricane, Port Royal schwer, dabei starben mehrere tausend Menschen.
1959 wurde beschlossen, den Hafen des Ortes wieder aktiv zu betreiben, unter anderem für den Export von Kaolin, was für die Stadt einen bedeutenden Aufschwung bedeutete.
Die Altstadt von Port Royal liegt am südlichen Ende der Landzunge, die in den Port Royal Sound hineinragt. Das Straßensystem ist systematisch in Nord-Süd- sowie West-Ost-Richtung aufgebaut. Die Straßen in Nord-Süd-Richtung sind die bedeutendsten Straßen des Stadtviertels; sie sind nach den Herkunftsstädten der ersten Einwanderer benannt. Die Paris Avenue ist die wichtigste Einkaufsstraße Port Royals. Am südlichen Ende befindet sich ein kleiner Strand.
Port Royal ist seit etwa Mitte der 1990er Jahre von sehr starkem Bevölkerungswachstum geprägt. Im Rahmen des US Census 2000 wurden für Port Royal 3.950 Einwohner ermittelt, zum Stichtag des darauffolgenden US Census 2010 lebten 10.678 Menschen in Port Royal. Dies entspricht einem Anstieg der Bevölkerung um mehr als 270 Prozent innerhalb eines Jahrzehnts. Der US Census 2020 ergab für Port Royal eine Einwohnerzahl von 14.220: Der relative Anstieg hat sich demzufolge abgekühlt, der Anstieg um 33,2 % über zehn Jahre liegt allerdings weiterhin stark über dem landesweiten Durchschnitt (rund 6 % pro Jahrzehnt).
