Pont-de-l’Isère liegt etwa acht Kilometer nördlich von Valence am Fluss Isère, der etwas südwestlich der Gemeinde in die Rhône mündet. Umgeben wird Pont-de-l’Isère von den Nachbargemeinden La Roche-de-Glun im Norden und Westen, Beaumont-Monteux im Osten sowie Châteauneuf-sur-Isère im Osten und Süden.
Durch die Gemeinde führt die alte Römerstraße, die Via Agrippa.
1856 wurde die Gemeinde La Roche-de-Glun aus der Gemeinde Pont-de-l’Isère herausgelöst und ist seitdem eigenständig.