Stadion Miejski in Posen (nach dem Umbau), Austragungsort des polnischen Pokalfinales 1999
Der Puchar Polski 1998/99 war die 45. Ausspielung des polnischen Pokalwettbewerbs. Die erste Runde wurde am 24. Juli 1998 ausgespielt. Der Wettbewerb wurde mit dem Finale am 13. Juni 1999 in Posen beendet.
Vorjahressieger Amica Wronki verteidigte seinen Titel und gewann den nationalen Pokal zum zweiten Mal. Endspielgegner GKS Bełchatów verlor nach 1996 auch sein zweites Finale. Durch den Pokalsieg qualifizierte sich Amica Wronki für die Teilnahme am UEFA-Pokal.
Die Vorrunde fand am 24. Juli 1998 mit 18 von 49 Teilnehmern aus den Woiwodschaften statt. Die übrigen Vertreter der Woiwodschaften hatten ein Freilos für die 1. Runde.
Die Spiele der 2. Runde wurden zwischen dem 11. und 12. August 1998 ausgetragen. Es nahmen die Gewinner der 1. Runde sowie die Mannschaften der 2. Liga der Saison 1997/98 teil.
Ab dem Viertelfinale wurden die Gewinner in Hin- und Rückspielen ermittelt. Die erstgenannten Mannschaften hatten zuerst Heimrecht. Die Hinspiele fanden am 10. März 1999, die Rückspiele am 14. April 1999 statt.
