Die Planungen für eine neue Kirche zwischen Innenstadt und Viehofen begannen bereits in der Zwischenkriegszeit, als durch die Eingemeindungen von Spratzern, Viehofen und Wagram und das Bevölkerungswachstum die Gründung einer neuen Pfarre nötig wurde. 1938 wurde das Grundstück angekauft, 1953 erfolgte die Gründung eines Kirchenbauvereins. Als die Pläne 1958 konkreter wurden, jährten sich die Marienerscheinungen in Lourdes gerade zum hundertsten Mal, weswegen die Kirche später auf Maria Lourdes geweiht wurde. Nach einem Architektenwettbewerb, den Franz Barnath gewann, folgte 1959 die Grundsteinlegung, 1961 wurde die Kirche geweiht.
1969 bekam die Kirche eine 3,70 m große Marienstatue des Südtiroler Bildhauers Johann Rifesser, die seitdem in der Mitte der Apsis steht.
Nach einer Außenrestaurierung und einer Erneuerung des Daches im Jahr 2018[1] erfolgte 2021 eine Renovierung des Innenraums.[2]
Normdaten (Körperschaft): GND: 415812-X(lobid, OGND, AKS) | VIAF: 149866967 | | Anmerkung: GND für „Pfarre Unbefl. Empfängnis der Allerh. Jungfrau Maria von Lourdes St. Pölten“.