Mit Gründungsjahr 1217 besitzt Inzersdorf eine der ältesten Pfarren im Raum Wien und die älteste des Gemeindebezirks Liesing. Nach der Türkenbelagerung verfiel der Pfarrhof und Inzersdorf wurde ein Zentrum des Protestantismus. Im Jahr 1742 wurde der gotische Vorgängerbau erneut renoviert, der aber am 8. Juni 1817 bei einem Brand zerstört wurde.[1]
Von 1818 bis 1821 wurde die heutige Pfarrkirche als klassizistisches Bauwerk errichtet. Es handelt sich um einen kreisförmigen Zentralbau mit Kuppel und nordseitigem Kirchturm. 1845/1846 erfolgten durch den Grundherrn Alois Miesbach ein Umbau und eine Erweiterung um eine Sakristei, einen Chor sowie einen ionischen Säulenportikus. Sein Neffe, der Industrielle Heinrich von Drasche-Wartinberg ließ 1860 an der Ostseite der Kirche eine Grabkapelle für seine Familie errichten, die seit 1978 als Marienkapelle Verwendung findet.
Seit 1846 ist in der Kirche eine Nachbildung des Lettnerkreuzes aus dem Stephansdom aufgestellt.[2] Nachdem das Original 1945 größtenteils verbrannte, wurde es nach Inzersdorfer Vorlage rekonstruiert.
Auch nach der Eingliederung des nördlichen Teil Inzersdorfs an Wien 1892 blieb das Pfarrgebiet unverändert und lag nun teils in Wien, teils in Inzersdorf. Erst 1989 wurde der nördliche Teil des Pfarrgebietes der Pfarre Salvator am Wienerfeld als Expositur zugeschlagen, aus dieser ging die Pfarre Emmaus am Wienerberg hervor. Die 1931 im Ortsteil Neustift errichtete Seelsorgestation wurde 1939 zur eigenständigen Pfarre Inzersdorf-Neustift erhoben, was ebenfalls eine Verkleinerung des Pfarrgebietes von St. Nikolaus bedeutete.
Im Zweiten Weltkrieg erlitt die Pfarrkirche Inzersdorf schwere Beschädigungen, die von 1956 bis 1964 beseitigt wurden. Eine weitere Sanierung und Umgestaltung erfolgte in den Jahren 1980/1981, bei der die Kirche auch neue, von Anton Lehmden gestaltete, Kirchenfenster erhielt. 1999 schuf der Künstler außerdem eine neue gemalte Darstellung des Kreuzwegs und fügte ihr die unübliche 15. Station der Auferstehung bei.
Ferdinand Opll: Liesing: Geschichte des 23. Wiener Gemeindebezirks und seiner alten Orte. Jugend und Volk, Wien 1982, ISBN 3-7141-6217-8.
Johann Weissensteiner: Regesten zur Geschichte der Pfarre Inzersdorf-St. Nikolaus (Wien 23), 1571–1932: nach den Pfarrakten im Diözesenarchiv Wien. Wiener Katholische Akademie, Wien 1983.
Organisationskomitee 750 Jahre Pfarre St. Nikolaus (Hrsg.): Festschrift 750 Jahre Pfarre St. Nikolaus Inzersdorf. Wien 1967.
↑ Franz R. Vorderwinkler: Sakrale Kunst in Österreich
↑Oliver Meidl: Auf den Spuren des Inzersdorfer Altarkreuzes. In: Pfarre St. Nikolaus Inzersdorf (Hrsg.): 200 Jahre Kirchenweihe Inzersdorf St. Nikolaus. Wien 2021, S.90–96.