Penemu ist die nördlichste der Faminseln, im Nordwesten von Raja Ampat. Südlich liegt die Hauptinsel Fam. Direkt vor der Küste von Penemu liegen mehrere kleine Felsinseln, darunter Keroeo.[2][3] Markant sind die steilen Felsklippen und enge Buchten an der Ostküste, mit teilweise sehr versteckten Zugängen. Zwischen den Felsen finden sich Sandstrände.[1]