Nach der (vorläufigen) Auflösung der Gruppe 1970 war er als Solo-Musiker aktiv. Am bekanntesten ist The Wedding Song (There is Love), den er für die Hochzeit von Peter Yarrow schrieb. Die Texte seiner Lieder handeln meist von christlichen und sozialen Themen.
Stookey ist verheiratet und lebt mit seiner Frau Betty in Maine.