Seit dem 1. Januar 1993 ist das Niels-Bohr-Institut mit dem Geophysikalischen Institut, dem Astronomische Observatorium und dem nach dem Physiker Hans Christian Ørsted benannten H.-C.-Ørsted-Institut zusammengelegt. Das so entstandene Niels Bohr Institutet for Astronomi, Fysik og Geofysik ist der Universität Kopenhagen angegliedert.