2019 wurde er zum Parteivorsitzenden in North Carolina gewählt.[5]
Nach der Präsidentschaftswahl 2020 war er im Electoral CollegeWahlmann für Trump.[6]
Nach der Wahlniederlage Trumps 2020 behauptete Whatley, es hätte Wahlfälschungen gegeben.[5] Er trat unter Hinweis auf den Rechtsstreit um die Wahl in Florida 2000 für gerichtliche Angriffe auf die Wahlergebnisse ein.[6]
Er war als Vorsitzender im Bundesstaat maßgeblich daran beteiligt, dass Trump 2020 in North Carolina gewann und daran, dass Senator Ted Budd 2023 gewählt wurde.[7]
Er wurde am 8. März 2024 nach dem Rücktritt von Ronna McDaniel zum RNC-Vorsitzenden gewählt. Als Co-Vorsitzende wurde ihm Lara Trump zur Seite gestellt.[8]
Kurz nach seinem Amtsantritt wurden zahlreiche Mitarbeiter entlassen. Ein Zusammenschluss mit der Wahlkampfkampagne von Donald Trump wurde angestrebt.[9]
Bewerber für Neueinstellungen nach der Entlassungswelle wurden gefragt, ob sie an die Big Lie glauben.[10]