Dougherty startete ihre Karriere in ihrer Geburtsstadt mit den Denver Diamonds. Neben dem Vereinsfußball spielte sie zwischen 1999 und 2002 ebenfalls im Women Soccer Team der Green Mountain High School, den Green Mountains Rams.[2] Sie gewann mit den Diamonds 2000 und 2002 die State Championships, bevor sie sich für ihr Studium an der Santa Clara University einschrieb. In dieser Zeit spielte sie für deren Women Soccer Team, den Santa Clara Broncos.[2] Nach ihrem Abschluss im Frühjahr 2007 ging sie zu den Chicago Red Stars. In Chicago spielte Dougherty zwischen 2009 und 2010 in 40 WPS Spielen und erzielte 1 Tor. Anschließend zog sie nach Florida um bei den Ligarivalen MagicJack zu spielen.[4] Sie lief in der Saison 2011 in 18 Spielen auf, bevor sie in der vierten Runde des Supplemental Draft zur NWSL an Position 32 vom Portland Thorns FC gezogen wurde.[5] Ihr Ligadebüt gab Dougherty dort am 13. April 2013 gegen den FC Kansas City, am 21. April erzielte sie bei einem 2:1-Sieg gegen den Seattle Reign FC ihren einzigen Treffer in der NWSL. Nach dem Gewinn der Meisterschaft mit Portland gab sie im November 2013 ihren Rücktritt vom Profisport bekannt.[6]