Hunziker wuchs in Märwil, Kanton Thurgau, auf. Sein Grossvater (Sohn von Jakob Hunziker) führte die Mosterei Märwil ab ihrer Gründung. Aus der Erbschaft seines Vaters stammt eine landwirtschaftliche Liegenschaft mit einem grossen Wald, den Hunziker noch jetzt bewirtschaftet.[1]
Er besuchte die Kantonsschule Frauenfeld und schloss 1958 mit der Matura¨Typ C ab. Anschliessend studierte er an der ETH Zürich Elektrotechnik und erhielt 1963 das Diplom als Elektroingenieur. Nach einem Zusatzstudium am Georgia Tech in den USA arbeitete er bei IBM Schweiz in der Kundenbetreuung.[2] Hunziker entschloss sich, berufsbegleitend zusätzlich Jurisprudenz an der Universität Zürich zu studieren. Er wurde 1983 bei Manfred Rehbinder mit einer Dissertation über das Immaterialgüterrecht zum Dr. jur. promoviert.[3][4]
Seine Leidenschaft als Bergsteiger entwickelte sich schon früh. Er trat dem Schweizer Alpen-Club (SAC) bei, wobei sein Vater bereits SAC-Mitglied und häufiger Bergsteiger bis ins hohe Alter gewesen war. Im Alter von 28 Jahren nahm Manfred Hunziker sich vor, 2437 Gipfel nach Herbert Maeders Klassiker Die Berge der Schweiz[5] zu besteigen.[6] Mit 65 Jahren fehlten ihm nur noch 97 Gipfel, nachdem er alle Gipfel über 4000 m Höhe bereits bestiegen hatte. Zu diesem Zeitpunkt setzte er sich das Ziel, die höchsten Gipfel in jedem Berggebiet von Nizza bis nach Wien (insgesamt 80 Gipfel) zu besteigen. Im Jahr 2004 fehlten ihm nur noch deren 15.[6][7] Er bestieg nicht nur Berge, sondern machte Abklärungen über die unterschiedlichen Routen, um mehrere umfangreiche Clubführer-Veröffentlichungen zu verfassen. Für die SAC-Sektion Uto leitet er seit 1978 Touren in den Alpen, vorwiegend in der Schweiz. Hunziker wurde 2001 zum Ehrenmitglied der Sektion Uto ernannt. Von seiner Verbundenheit mit der Bergwelt zeugt eine Spende für die Erneuerung der Domhütte der Sektion Uto, welche Hunziker 2011 machte.[1][8] Als Alterswohnsitz wählte er das 22. Stockwerk eines Hochhauses in Zürich-Altstetten, von wo er freie Sicht auf die Alpen und die Stadt Zürich hat.[9][10]