Der MLB Draft 2016, der Entry Draft der Major League Baseball, fand vom 9. bis 11. Juni 2016 statt.
Die Draftreihenfolge war entgegengesetzt zu den Platzierungen der MLB-Saison 2015, so dass das schlechteste Team des Vorjahres, die Philadelphia Phillies, die erste Wahl (Pick) hatten.[1] Die Phillies entschieden sich für den 1998 in Encinitas geborenen Outfielder Mickey Moniak.[2]
Der aktuelle Meister Kansas City Royals hatte, da er Ian Kennedy unter Vertrag genommen hat, keinen Pick in der ersten Runde zur Verfügung und griff erst an 67ster Stelle in den Draft ein.[3][1]