Als Musiker war er mit seiner Showband Discotrain aktiv. Im Juni 2011 veröffentlichte er die CD München im Sommer bei Sony Music. Zirka 50 Prozent der Musik und 75 Prozent der Texte stammten aus seiner Feder. Im Jahr 2011 musste Hannesschläger beruflich wegen mehrerer Beinverletzungen pausieren.[2] Ab April 2012 drehte er wieder Die Rosenheim-Cops und war ab dem 15. Januar 2013 erneut auf Sendung.
Sozial engagierte sich Hannesschläger u. a. für die Aktion „Weihnachten im Schuhkarton“ des Vereins Geschenke der Hoffnung, die er 2015 im Rahmen einer Kampagne mit weiteren Prominenten unterstützte.[3] Hannesschläger unterstützte des Öfteren öffentliche Wahlkampfveranstaltungen der SPD[4] und der Grünen.
Im Sommer 2018 heiratete er seine Lebensgefährtin, die Münchnerin Bettina Geyer.[5] Anfang Oktober 2019 wurde bekannt, dass Joseph Hannesschläger an einer Krebserkrankung (neuroendokriner Tumor) mit Metastasen in der Leber litt, die sich nur palliativ behandeln ließ, und er darum aus der Serie Die Rosenheim-Cops aussteigen musste.[6][7]
Joseph Hannesschläger starb am 20. Januar 2020 im Alter von 57 Jahren in einem Hospiz in München an den Folgen seiner Erkrankung.[8] Die öffentliche Trauerfeier wurde am 27. Januar wie von Hannesschläger gewünscht in der Trauerhalle des Krematoriums auf dem Ostfriedhof in München abgehalten. Familie, Freunde, Fans und Kollegen nahmen Abschied. Freund Christian Ude sowie die Kollegen aus den Rosenheim-Cops, Max Müller und Alexander Duda, hielten Trauerreden. Statt Blumen und Kränzen wünschte sich Hannesschläger Spenden für den Verein Mukoviszidose.[9] Nach der Kremierung wurde die Urne zu einem späteren Zeitpunkt auf dem Ostfriedhof im engsten Familienkreis, im Grab seiner Mutter (Grab 154-7-26), beigesetzt.[10][11]