Jonathan „Jon“ Chu ist Absolvent der University of Southern California. Sein Debüt als Regisseur, Drehbuchautor sowie Produzent gab er 2001 mit dem Kurzfilm Silent Beats. Sein erster Langspielfilm war Step Up to the Streets aus dem Jahr 2008. Er inszenierte auch die zwei Jahre darauf folgende Fortsetzung Step Up 3D. Am vierten Teil der Step-Up-Reihe Step Up: Miami Heat (2012) war Chu als Ausführender Produzent beteiligt.
In den Jahren 2010 bis 2011 war er in verschiedenen Funktionen bei der Serie LXD – Legion der außergewöhnlichen Tänzer tätig. Zudem betreute er als Ausführender Produzent mehrere andere Fernsehprojekte, darunter The Arena und S2dio City.
2018 wurde die von ihm inszenierte Romanverfilmung Crazy Rich (Crazy Rich Asians) veröffentlicht, die gemessen an den Produktionskosten in Höhe von 26,5 Millionen US-Dollar, ein finanzieller Erfolg wurde und weltweit rund 238 Millionen US-Dollar einspielte.
Chu drehte ab 2022 Wicked, die Filmadaption des Musicals Wicked – Die Hexen von Oz. Der erste Teil feierte seine Weltpremiere am 3. November 2024 im State Theatre im australischen Sydney.[2] Die Veröffentlichung des zweiten Teils ist für 2025 geplant.
Chu ist seit dem Jahr 2018 mit Kristin Hodge verheiratet. Das Paar hat drei Töchter und zwei Söhne.[3]