Johann Ernst Schulz (* 20. Dezember 1742 in Dreysee in Ostpreußen; † 9. April 1806 in Königsberg (Preußen)) war ein deutscher lutherischer Theologe und ab 1778 Generalsuperintendent in Königsberg.
In seinem zehnten Lebensjahr kam er nach Königsberg, wo er die Altstädter Schule besuchte und 1759 ein Studium an der Universität Königsberg begann. Sein prägender Lehrer wurde Theodor Christoph Lilienthal (1717–1781), bei dem er 1760 eine Hauslehrerstelle antrat. 1767 wurde er Lehrer am Waisenhaus in Königsberg und erhielt dort 1771 eine Predigerstelle. Nach Veröffentlichung einiger Schriften theologischen Inhalts wurde er 1778 Doktor der Theologie und ordentlicher Professor der Theologie an der Königsberger Hochschule. Damit verbunden ernannte man ihn zum königlich-preußischen Konsistorialrat, Oberhofprediger und Generalsuperintendenten in Königsberg für Ostpreußen als Nachfolger des zurückgetretenen Johann August von Starck. Als Generalsuperintendent saß er qua Amt dem lutherischen Preußischen Konsistorium zu Königsberg vor, der regionalen Kirchenbehörde des Lutherischen Oberkonsistoriums zu Berlin, die für die gesamte Monarchie zuständig waren.[1] 1783 stieg er in die zweite theologische Professur auf und 1799 in die erste theologische Professur, die er bis zu seinem Lebensende innehatte.
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