Nach dem Besuch der Ransom Everglades High School schloss er 1975 das Middlebury College ab. Sein erster Roman Tropical Depression: A Novel of Suspense wurde 1994 veröffentlicht. In den 1990er-Jahren folgten noch drei Werke, jedoch erst 2004 feierte Lindsay mit Darkly Dreaming Dexter den Durchbruch und seinen ersten großen Erfolg. In der Reihe erschienen in den Jahren danach mehrere Fortsetzungen. Die Hauptfigur, Dexter Morgan, ist ein Serienmörder, der für die Polizei als Forensiker arbeitet und in seinem Doppelleben Verbrecher tötet, die ihrer Bestrafung durch das Gesetz entgangen sind. Im Jahr 2006 wurde Lindsays Idee vom US-amerikanischen Pay-TV-Sender Showtime für eine Fernsehserie adaptiert, welche bis 2013 erfolgreich unter dem Titel Dexter lief. Die Rolle des Dexter wurde von Michael C. Hall verkörpert. Seit 2008 wurde die Serie auch im deutschsprachigen Fernsehen ausgestrahlt.