Jacob Benton besuchte die öffentlichen Schulen seiner Heimat und danach bis 1839 das Burr and Burton Seminary in Manchester (Vermont). Anschließend war er selbst einige Jahre als Lehrer tätig. Im Jahr 1842 zog er nach Lancaster in New Hampshire. Nach einem Jurastudium und seiner im Jahr 1843 erfolgten Zulassung als Rechtsanwalt begann er in seiner neuen Heimatstadt in diesem Beruf zu arbeiten.
1866 wurde Benton im dritten Distrikt von New Hampshire in das US-Repräsentantenhaus in Washington gewählt, wo er am 4. März 1867 die Nachfolge von James W. Patterson antrat. Nach einer Wiederwahl im Jahr 1868 konnte er bis zum 3. März 1871 zwei Legislaturperioden im Kongress absolvieren. In diese Zeit fiel der Streit seiner Partei mit Präsident Andrew Johnson um die Reconstruction nach dem Bürgerkrieg. Dieser Streit führte zum letztlich erfolglosen Amtsenthebungsverfahren gegen den Präsidenten. Ebenfalls während Bentons Zeit im Kongress wurde der 14. Verfassungszusatz verabschiedet.
Im Jahr 1870 lehnte Benton eine weitere Kandidatur für den Kongress ab. In der Folge arbeitete er wieder als Anwalt. Er starb am 29. September 1892 in Lancaster und wurde dort auch beigesetzt.