Nach dem Irak-Krieg kehrte al-Hasani 2003 in den Irak zurück und arbeitete im von den Koalitionskräften eingesetzten irakischen Regierungsrat. In dieser Zeit erarbeitete sich die IIP in der sunnitischen Provinz al-Anbar, die eine Hochburg der Terroristen ist, großen Einfluss. 2004 half al-Hasani mit, einen vorübergehenden Waffenstillstand mit Aufständischen in Falludscha auszuhandeln.
In der Übergangsregierung, die auf den irakischen Regierungsrat folgte, und in der der säkulareSchiitIyad AllawiMinisterpräsident war, bekam al-Hasani den Posten des Industrieministers.[3] Das Privatisierungsprogramm seines Ministeriums hatte nicht viel Erfolg.[2]
Als er US-Offensiven in Falludscha unterstützte, wurde er aus der IIP ausgeschlossen, da sich die Partei aus Protest gegen die amerikanischen Militäraktionen aus der Übergangsregierung zurückgezogen und al-Hasani sich geweigert hatte, seinen Ministerposten aufzugeben.[2]
Nach den irakischen Parlamentswahlen vom 30. Januar2005, bei denen al-Hasani auf der vom damaligen Übergangspräsidenten Ghazi al-Yawar geführten Liste The Iraqis antrat, gab es zähe Verhandlungen um den Posten des Parlamentspräsidenten. Da seine Gegenkandidaten entweder Verbindungen zum Regime von Saddam Hussein hatten, was für die Schiiten inakzeptabel war, Mitglieder der überwiegend schiitischen Vereinigten Irakischen Allianz waren, was für die Sunniten nicht akzeptabel war, oder den Posten ablehnten (dies tat Ghazi al-Yawar), wurde al-Hasani als Kompromisskandidat von der neuen Nationalversammlung des Irak zum Parlamentspräsidenten gewählt.
Al-Hasani gilt bei vielen Sunniten als Außenstehender, doch er ist ein gemäßigter Islamist. Direkt nach seiner Ernennung nannte er „Sicherheit und eine funktionierende Wirtschaft“ als wichtigste Ziele der neuen irakischen Regierung.[2]
Im September 2007 verließ al-Hasani die Regierungskoalition von Allawi, dem er diktatorisches Verhalten vorwarf.[4]