Stannarius erhielt, als die Universitäten von Kassel und Marburg am Standort Marburg wieder zusammengelegt wurden, zum 16. Juni 1653 die Professur der Logik, Metaphysik und Physik an der Marburger Universität. Am 20. Juni 1653 erfolgte dort seine Promotion zum Dr. phil. Außerdem war er 1653 und 1654 Dekan der Philosophischen Fakultät. Zum 30. Juni 1660 bekam er die dritte ordentliche Professur der Theologie übertragen. Kurz darauf, am 8. November 1660, wurde er mit der DissertationDe Deo uno & trio zum Dr. theol. promoviert. 1666 hatte er das Dekansamt an der Theologischen Fakultät inne und in den Jahren 1657 und 1669 das Rektorenamt der Universität.
Friedrich Wilhelm Strieder: Grundlage zu einer Hessischen Gelehrten und Schriftsteller Geschichte seit der Reformation bis auf gegenwärtige Zeiten, Band 15, Kassel 1806, S. 217–224.
Franz Gundlach: Catalogus professorum academiae Marburgensis 1, Von 1527 bis 1910, Elwert, Marburg 1927, Nr. 483.