Gilles Cantagrel stammt aus einer musikbegeisterten Pädagogen-Familie. Er begann im Alter von 10 Jahren mit seiner Musikausbildung. Ab 1949 sang er in einem Knabenchor, als er Johann Sebastian Bach entdeckte.
Er war Produzent von Radiosendungen in Frankreich (France Musique ab 1979) und im Ausland. Von 1984 bis 1987 war Cantagrel Programmdirektor von France Musique. 1999 war er als künstlerischer Berater der Direktion von France Musique tätig. Von 1992 bis 2000 war er auch Vizepräsident der musikalischen Kommission der Union Européenne de Radiodiffusion et télévision.
Cantagrel trat außerdem häufig als Moderator bei Konzerten im Fernsehen und Hörfunk auf. Er schrieb eine Fernsehserie über die Geschichte der Orgel in Europa. 1985 nahm er an der Gründung der Musikausstellung Musicora teil.
Gilles Cantagrel war von 2003 bis 2008 Vorsitzender der Association des Grandes Orgues de Chartres. Er ist Vorstandsmitglied mehrerer Einrichtungen, etwa des Centre de Musique Baroque de Versailles, und Kuratoriumsmitglied des Bach-Archivs Leipzig (seit 2003). 2001 bis zu seiner Abschaffung 2018 wurde er vom französischen Kulturministerium zum Mitglied des Komitees für nationale Gedenkfeiern ernannt.
Er war Dozent an der Sorbonne, am Pariser Konservatorium, und an verschiedenen Konservatorien und Universitäten in Frankreich, Belgien, der Schweiz und Kanada. Er hält Vorträge in Europa und Nordamerika und nimmt an den Jurys internationaler Wettbewerbe teil.[1]
Bach en son temps (Paris, 1982), nouvelle édition, revue et augmentée en 1997, ISBN 2-213-60007-4.
Guide de la mélodie et du lied (dir. avec Brigitte François-Sappey), Paris, 1994, ISBN 978-2-213-59210-7.
Le Moulin et la Rivière: Air et variations sur Bach, Paris, Fayard, coll. « Les chemins de la musique », 1998, ISBN 2-213-60128-3, OCLC467090761, notice BnF no FRBNF36709207.
Georg Philipp Telemann ou le Célèbre Inconnu (Genève, 2003–2005), premier livre en français sur ce compositeur, ISBN 2-940310-15-7.
Beiträge in: Bach, la Chair et l'Esprit. Bach, earthly & divine. Bach, Musik für Himmel und Erde. Buch mit 6 CDs. Alpha, Paris 2011.
Carl Philipp Emanuel Bach et l'âge de la sensibilité. Genève 2013, ISBN 978-2-940310-46-3.
La Rencontre de Lübeck, Bach et Buxtehude. Paris, 2003, ISBN 978-2-220-05808-5, Nouvelle édition Paris, 2015.
J.-S. Bach, l'œuvre instrumentale (Buchet-Chastel, Paris, 2018) a été distingué par une "clef d'or", décernée annuellement parmi les meilleures productions de l'année, par la revue ResMusica, ISBN 978-2-283-03113-1, OCLC1019660851.
Air und Variationen über BACH – Mensch und Werk, Verlag Klaus-Jürgen Kamprad, 2020, ISBN 978-3-95755-655-4.
Sur les traces de J-S Bach (Buchet-Chastel, 2021, französische Ausgabe, ISBN 978-2283034255)