1963 war Potterton Co-Regisseur von Christmas Cracker an der Seite von Norman McLaren, Jeff Hale und Grant Munro. Mit dem Film gewann er auch den Golden Gate Award. 1965 war er Regisseur des Films Bahnfahrt mit Buster Keaton, dem letzten Stummfilm von Buster Keaton. Mit diesem erhielt er einen Ehrenpreis der Berlinale.[2] Außerdem trat er in der Dokumentation Buster Keaton Rides Again auf.
Als Animator arbeitete er an der Zeichentrickserie Cool McCool (1966–1969) sowie dem Beatles-Film Yellow Submarine. In den 1970er Jahren drehte er Film- und Animations-Passagen für die Kinderserien Sesamstraße und The Electric Company.
1968 gründete er seine eigene Produktionsgesellschaft für Film und Zeichentrick. Vor seiner Schließung 1974 produzierte sie unter anderem Der selbstsüchtige Riese (1971) von Peter Sander, Larry Kents Fleur Bleue (1971), Mike Mills The Happy Prince (1974), The Little Mermaid (1974) und The Christmas Messenger (1975).[3]
Seine letzte große Arbeit war der Film Heavy Metal von 1981, bei dem er zusammen mit Jimmy T. Murakami Regie führte. Der Film basierte auf den französischen Schwermetall-Comics.
In den 1980er und 1990er Jahren war er weiterhin als Regisseur und Animator für Film und Fernsehen tätig.