Die Saison 2006/07 der Oberliga Nord war die 51. Spielzeit der Fußball-Oberliga Nord in ihrer bisherigen Form und die 13. als vierthöchste Spielklasse in Deutschland. Die Meisterschaft und den Aufstieg in die Regionalliga sicherte sich die zweite Mannschaft des VfL Wolfsburg mit neun Punkten Vorsprung auf den BV Cloppenburg.
Die Zweitmannschaften von Erst- und Zweitligisten durften nur Spieler einsetzen, die während des gesamten Spieljahres (1. Juli bis 30. Juni) nicht älter als 23 Jahre waren (U23). Somit waren in dieser Saison grundsätzlich nur Spieler spielberechtigt, die am oder nach dem 1. Juli 1983 geboren wurden. Darüber hinaus durften sich drei ältere Spieler gleichzeitig im Spiel befinden.
1
Die zweite Mannschaft von Holstein Kiel musste aufgrund des Abstiegs der ersten Mannschaft von der Regionalliga in die Oberliga zwangsabsteigen.
2
Der VfR Neumünster, SV Arminia Hannover und VfL 93 Hamburg erhielten keine Lizenz für die folgende Spielzeit und stiegen ab.
Kreuztabelle
Die Kreuztabelle stellt die Ergebnisse aller Spiele dieser Saison dar. Die Heimmannschaft ist in der linken Spalte, die Gastmannschaft in der oberen Zeile aufgelistet.
Die Partie zwischen dem ASV Bergedorf 85 und dem SV Henstedt-Rhen (29. Spieltag) wurde mit drei Punkten und 2:0 Toren für Henstedt-Rhen gewertet, da Bergedorf nicht antrat.