Am EHF-Europapokal der Pokalsieger 2000/01 nahmen 36 Handball-Vereinsmannschaften teil, die sich in der vorangegangenen Saison in ihren Heimatländern im Pokalwettbewerb für den Wettbewerb qualifizieren konnten. Es war die 26. Austragung des Pokalsiegerwettbewerbs. Titelverteidiger war der spanische Verein Portland San Antonio. Die Pokalspiele begannen am 14. Oktober 2000 und endeten mit dem zweiten Finalspiel am 28. April 2001. Im Finale konnte sich SG Flensburg-Handewitt gegen Ademar León durchsetzen.[1]
Der Wettbewerb startete mit vier Spielen in Runde 2. Die Sieger zogen in Runde 3 ein, in der weitere, höher eingestufte, Mannschaften einstiegen. Alle Runden inklusive des Finales wurden im K.-o.-System mit Hin- und Rückspiel durchgeführt. Der Gewinner des Finales war Europapokalsieger der Pokalsieger der Saison 2000/01.
Runde 2
Die Hin- und Rückspiele fanden zwischen dem 14. Oktober 2000 und dem 22. Oktober 2000 statt.