Erik Messerschmidt wuchs in Cape Elizabeth in der Nähe von Portland in Maine auf.[2] Er studierte Filmproduktion am Emerson College in Boston.[3] Einer seiner Kommilitonen war der spätere Filmemacher Jeremiah Zagar, mit dem er gemeinsam den preisgekrönten Indie-Dokumentarfilm In a Dream realisierte.
Nach seinem Umzug nach Los Angeles war Messerschmidt als Beleuchter in Fernsehserien wie Bones – Die Knochenjägerin, Mad Men und Alle hassen Chris tätig. In dieser Zeit sammelte er auch Erfahrungen als Kameramann und drehte Werbespots, Kurzfilme und Dokumentarfilme. Er wurde nach seiner Zusammenarbeit mit dem Kameramann Jeff Cronenweth von diesem an den Regisseur David Fincher empfohlen. Der setzte Messerschmidt bei seinem Film Gone Girl – Das perfekte Opfer als Oberbeleuchter und später als Kameramann für die meisten Episoden der Fernsehserie Mindhunter ein und drehte auch die FilmbiografieMank und den Action-Thriller Der Killer mit ihm.[3]