Dabei werden durch eine Emitterkathode Elektronen mit niedriger Energie erzeugt. Diese werden von mehrfach protoniertenMolekülen in der Gasphase eingefangen, wobei reduzierte Radikal-Kationen [M+nH](n−1)+· entstehen. Diese zerfallen schnell zu kleineren Fragmenten.
ECD produziert signifikant andere Fragmentionen als Fragmentierungsverfahren wie Collision-Induced Dissociation (CID) oder Infrared Multiphoton Dissociation (IRMPD). Diese Methoden erhöhen die interne Vibrationsenergie eines Ions – im Gegensatz zur ECD. ECD wird überwiegend bei der Untersuchung von Proteinen in der FT-ICR-MS eingesetzt. Ein Nachteil dieses Verfahrens ist die geringe Ausbeute.
Gene Hart-Smith: A review of electron-capture and electron-transfer dissociation tandem mass spectrometry in polymer chemistry. In: Analytica Chimica Acta (= Polymer Mass Spectrometry). Band808, 2014, S.44–55, doi:10.1016/j.aca.2013.09.033.