Am EHF Challenge Cup 2009/10 nahmen 34 Handball-Vereinsmannschaften teil, die sich in der vorangegangenen Saison in ihren Heimatländern für den Wettbewerb qualifiziert hatten. Es war die 10. Austragung des Challenge Cups unter diesem Namen. Die Pokalspiele begannen am 3. Oktober 2009, das Rückrundenfinale fand am 23. Mai 2010 statt. Titelverteidiger des EHF Challenge Cups war der französische Verein HBC Nîmes . Der Titelgewinner in der Saison war der deutsche Verein Buxtehuder SV .

Es nahmen die 8 Sieger des Achtelfinales teil. Die Spiele fanden vom 13. – 21. März 2010 statt.

Mannschaft 1	Mannschaft 2	Hinspiel	Rückspiel	Gesamt
Niederlande Bizztravel Dalfsen	Polen Vistal Laczpol Gdansk	14.03.10	20.03.10	48  : 56
		26 : 25 (11 : 15)	22 : 31 (11 : 12)
		Dalfsen 700 Zuschauer	Gdansk 2200 Zuschauer
Deutschland Buxtehuder SV	Frankreich E.S Besancon Feminin	13.03.10	21.03.10	63 : 42
		37 : 14 (17 : 6)	26 : 28 (10 : 10)
		Buxtehude 1500 Zuschauer	Besancon 1500 Zuschauer
Ukraine Podatkova-Istil	Deutschland Frisch Auf Göppingen	19.03.10	21.03.10	43 : 69
		16 : 42 (8 : 20)	27 : 27 (10 : 16)
		Wernau 400 Zuschauer	Göppingen 500 Zuschauer
Island Fram	Nordmazedonien HC Metalurg	13.03.10	14.03.10	44 : 47
		29 : 26 (14 : 13)	15 : 21 (6 : 8)
		Skopje 800 Zuschauer	Skopje 800 Zuschauer

Es nahmen die 4 Sieger aus dem Viertelfinale teil. Die Spiele fanden vom 10. April bis 2. Mai 2010 statt.

Mannschaft 1	Mannschaft 2	Hinspiel	Rückspiel	Gesamt
Deutschland Frisch Auf Göppingen	Polen Vistal Laczpol Gdansk	10.04.10	02.05.10	57 : 46
		29 : 24 (16 : 12)	28 : 22 (13 : 13)
		Göppingen 900 Zuschauer	Gdansk 1000 Zuschauer
Nordmazedonien HC Metalurg	Deutschland Buxtehuder SV	10.04.10	28.04.10	50 : 52
		22 : 21 (11 : 12)	28 : 31 (12 : 15)
		Skopje 800 Zuschauer	Buxtehude 1500 Zuschauer

Es nahmen die 2 Sieger aus dem Halbfinale teil. Das Hinspiel fand am 16. Mai 2010 statt. Das Rückspiel fand am 23. Mai 2010 statt.

Mannschaft 1	Mannschaft 2	Hinspiel	Rückspiel	Gesamt
Deutschland Frisch Auf Göppingen	Deutschland Buxtehuder SV	16.05.10	23.05.10	54 : 68
		28 : 40 (16 : 19)	26 : 28 (15 : 16)
		Göppingen 2200 Zuschauer	Buxtehude 1600 Zuschauer

• EHF Champions League der Frauen 2009/10
• EHF-Pokal der Frauen 2009/10
• EHF-Europapokal der Pokalsieger der Frauen 2009/10
• Liste der Handball-Europapokalsieger der Frauen
• Liste der Handball-Europapokalsieger der Männer

• EHF Challenge Cup auf der offiziellen Seite des EHF (engl.)