1 RK Bjelovar; 2 RK Siscia Teilnehmer am EHF Challenge Cup 2011/12: Viertelfinale erreicht Ausgeschieden im Achtelfinale Sieger des EHF Challenge Cup
Am EHF Challenge Cup 2011/12 nahmen 36 Handball-Vereinsmannschaften teil, die sich in der vorangegangenen Saison in ihren Heimatländern für den Wettbewerb qualifiziert hatten. Es war die 12. Austragung des Challenge Cups unter diesem Namen. Die Pokalspiele begannen am 30. September 2011, das Rückrundenfinale fand am 28. Mai 2012 statt. Titelverteidiger des EHF Challenge Cups war der slowenische Verein RK Koper. Der Titelgewinner in der Saison war der griechische Verein AO Diomidis Argos.
Das Turnier der Gruppe A fand vom 30. September bis zum 2. Oktober in der Tal-Qroqq University Sports Hall in Msida statt.
Der Tabellenerste qualifizierte sich für die 3. Runde. Die drei Letzten schieden aus dem Turnier aus.
Es nahm der Sieger der 2. Runde und die 31 Mannschaften, die sich vorher für den Wettbewerb qualifiziert hatten, teil. Die Auslosung der 3. Runde fand am 26. Juli 2011 um 11:00 Uhr (UTC+2) in Wien statt. Die Hinspiele fanden am 26./27. November und 2./3. Dezember 2011 statt. Die Rückspiele fanden am 27. November und 3./4. Dezember 2011 statt.
* RK Maribor Branik qualifizierte sich aufgrund der Auswärtstorregel für die nächste Runde.
Achtelfinale
Es nahmen die 16 Sieger der 3. Runde teil. Die Auslosung des Achtelfinales fand am 6. Dezember 2011 um 11:00 Uhr (UTC+2) in Wien statt. Die Hinspiele fanden am 10./11./18. Februar 2012 statt. Die Rückspiele fanden am 11./18./19. Februar 2012 statt.
* AC Diomidis Argos und Sporting CP qualifizierten sich aufgrund der Auswärtstorregel für die nächste Runde.
Viertelfinale
Es nahmen die acht Sieger aus dem Achtelfinale teil. Die Auslosung des Viertelfinales fand am 21. Februar 2011 um 11:00 Uhr (UTC+2) in Wien statt. Die Hinspiele fanden am 17./18./24. März 2012 statt. Die Rückspiele fanden am 24./25. März 2012 statt.
Es nahmen die vier Sieger aus dem Viertelfinale teil. Die Auslosung des Halbfinales fand am 27. März 2012 um 11:00 Uhr (UTC+2) in Wien statt. Die Hinspiele fanden am 21. April 2012 statt. Die Rückspiele fanden am 28./29. April 2012 statt.
Es nahmen die zwei Sieger aus dem Halbfinale teil. Die Auslosung des Finales fand am 2. Mai 2012 um 11:00 Uhr (UTC+2) in Köln statt. Das Hinspiel fand am 20. Mai 2012 statt. Das Rückspiel fand am 28. Mai 2012 statt.