Am EHF-Pokal 2005/06 nahmen 56 Handball-Vereinsmannschaften teil, die sich in der vorangegangenen Saison in ihren Heimatligen für den Wettbewerb qualifiziert hatten. Es war die 25. Austragung des EHF-Pokals bzw. des IHF-Pokals. Titelverteidiger war TUSEM Essen. Die Pokalspiele begannen am 3. September 2005, das zweite Finalspiel fand am 30. April 2006 statt. Im Finale konnte sich TBV Lemgo gegen Frisch Auf Göppingen durchsetzen[1].
In Runde 1 starteten 16 niedriger eingestufte Vereine in den Wettbewerb. Dazu stießen in Runde 2 weitere 17 Mannschaften, die sich ebenso in der vorangegangenen Saison in ihren Heimatligen qualifiziert hatten, und die 7 Verlierer der Qualifikation aus der EHF Champions League 2005/06. In Runde 3 stiegen weitere 16 höher eingestufte Mannschaften ein. Alle Runden inklusive des Finales wurden im K.-o.-System mit Hin- und Rückspiel durchgeführt.
Runde 1
Die Hin- und Rückspiele fanden zwischen dem 2. September 2005 und dem 11. September 2005 statt.
Gesamt
Hinspiel
Rückspiel
HC TallinnEstland
70:34
Bulgarien HC Spartak Warna
37:15
33:19
HK Lokomotiv WarnaBulgarien
72:49
Zypern 1960 Intercollege AC Nicosia
38:22
34:27
HC Tbilisi Georgien
28:98
IslandValur Reykjavík
15:51
13:47
Vilniaus VHC Šviesa Litauen
46:59
EstlandPölva Serviti
22:27
24:32
Union Beynoise Belgien
43:55
PortugalABC Braga
24:31
19:24
KH Besa Peja
53:57
NiederlandeBevo HC
28:29
25:28
Trabzon BelediyesporTurkei
70:60
Moldau Republik HC Chișinău
33:33
37:27
RK Bosna Sarajevo Bosnien und Herzegowina
65:65 *
IsraelMaccabi Rishon LeZion
39:28
26:37
*
Maccabi Rishon LeZion zog aufgrund der Auswärtstorregel in Runde 2 ein.
Runde 2
Die Hin- und Rückspiele fanden zwischen dem 1. Oktober 2005 und dem 9. Oktober 2005 statt.