Am EHF-Pokal 1996/97 nahmen 33 Handball-Vereinsmannschaften teil, die sich in der vorangegangenen Saison in ihren Heimatligen für den Wettbewerb qualifiziert hatten. Der Titelverteidiger war BM Granollers. Es war die 16. Austragung des EHF-Pokals bzw. des IHF-Pokals. Die Pokalspiele begannen am 4. September 1998, das zweite Finalspiel fand am 19. April 1999 statt. Im Finale konnte sich SG Flensburg-Handewitt gegen Virum-Sorgenfri HK durchsetzen[1].
Der Wettbewerb startete mit einer Ausscheidungsrunde mit einem Spiel. Der Sieger zog in das Sechzehntelfinale ein. Alle Runden inklusive des Finals wurden im K.-o.-System mit Hin- und Rückspiel durchgeführt.
Ausscheidungsrunde
Gesamt
Hinspiel
Rückspiel
Arkatron MinskBelarus
57:48
Bosnien und Herzegowina RK Bosna Visoko
25:21
32:27
Sechzehntelfinals
Gesamt
Hinspiel
Rückspiel
ZSKA MoskauRussland
50:35
Turkei Beşiktaş Istanbul
30:16
20:19
HRK KarlovacKroatien
51:44
Polen Śląsk Wrocław
31:21
20:23
HC BruckOsterreich
43:38
Griechenland AS Filippos Verias
27:17
16:21
BM GranollersSpanien
52:38
Belgien Union Beynoise
24:19
28:19
SD Octavio VigoSpanien
65:43
Belarus 1995 Arkatron Minsk
36:26
29:17
Pestszentlörinc Elektromos SE Ungarn
47:47 *
SlowenienRK Velenje
25:25
22:22
SG Flensburg-HandewittDeutschland
50:37
Schweiz Kadetten Schaffhausen
27:16
23:21
HC Browary Ukraine
45:51
DanemarkVirum-Sorgenfri HK
23:21
22:30
HC Nes Ziona Israel
39:57
TschechienHC Baník Karviná
20:26
19:31
Kentro Neotitos Larnacos Zypern 1960
53:55
LuxemburgHC Standard Luxemburg
23:24
30:31
Minaur Baia Mare Rumänien
37:44
SchwedenHK Drott Halmstad
20:17
17:27
Sporting Lissabon Portugal
39:42
FrankreichMontpellier HB
22:16
17:26
Jūrmalas PSK RigaLettland
74:46
Georgien 1990 HC Mamuli Tbilisi
41:23
33:23
RK Prespa ResenNordmazedonien
37:34
Jugoslawien Sozialistische Föderative Republik RK Partizan Belgrad
16:11
21:23
Alpi PratoItalien
45:44
Norwegen SIF Håndball
26:20
19:24
UMF StjarnanIsland
38:35
Niederlande V&L Geleen
22:18
16:17
*
RK Velenje zog aufgrund der Auswärtstorregel in das Achtelfinale ein.
Achtelfinals
Gesamt
Hinspiel
Rückspiel
Jūrmalas PSK Riga Lettland
47:67
SpanienSD Octavio Vigo
23:31
24:36
HC Standard Luxemburg Luxemburg
30:74
SlowenienRK Velenje
12:37
18:37
HK Drott Halmstad Schweden
49:52
DanemarkVirum-Sorgenfri HK
26:23
23:29
Alpi PratoItalien
38:37
Kroatien HRK Karlovac
18:15
20:22
Montpellier HBFrankreich
41:35
Russland ZSKA Moskau
24:18
17:17
RK Prespa Resen Nordmazedonien
44:46
SpanienBM Granollers
22:16
22:30
UMF StjarnanIsland
65:59
Osterreich HC Bruck
33:24
32:35
HC Baník Karviná Tschechien
39:47
DeutschlandSG Flensburg-Handewitt
21:21
18:26
Viertelfinals
Gesamt
Hinspiel
Rückspiel
UMF Stjarnan Island
45:56
SpanienSD Octavio Vigo
26:28
19:28
Alpi Prato Italien
47:51
DanemarkVirum-Sorgenfri HK
21:25
26:26
Montpellier HB Frankreich
45:46
SpanienBM Granollers
21:20
24:26
RK Velenje Slowenien
36:57
DeutschlandSG Flensburg-Handewitt
19:28
17:29
Halbfinals
Gesamt
Hinspiel
Rückspiel
BM Granollers Spanien
44:47
DeutschlandSG Flensburg-Handewitt
23:25
21:22
SD Octavio Vigo Spanien
57:58
DanemarkVirum-Sorgenfri HK
30:27
27:31
Finale
Das Hinspiel in Brøndby fand am 13. April 1997 statt und das Rückspiel in Flensburg am 18. April 1997.