Er befasste sich auch mit Paläobotanik, unter anderem über Samenfarne (1904)[1], deren Verwandtschaft mit Samenpflanzen er mit Francis Wall Oliver (1864–1951)[2] entdeckte. Zur Paläobotanik wurde er von William Crawford Williamson geführt, einem Pionier der Paläobotanik in England und Professor in Manchester. Aus einem Kurs am University College über Paläobotanik, den Scott 1896/97 hielt, entstand 1900 ein einflussreiches Lehrbuch.
↑Oliver, Scott: On the structure of the Palaeozoic seed Lagenostoma Lomaxi, with a statement of the evidence upon which it is referred to Lyginodendron, Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B, 197 1904, S. 193–247
↑Frank Oliver, 1864–1951, Professor am University College und in Kairo. Fellow der Royal Society.