Der Río Duerna entspringt – je nach verfügbaren Regen- oder Schmelzwassermengen – aus mehreren Quellbächen in einer Höhe von etwa 1300 bis 1400 m – auf dem Gebiet der Gemeinde Lucillo an der Ostflanke der Montes de León und fließt zunächst in südöstliche, später dann in östliche Richtung. Ungefähr einen Kilometer nördlich des Ortes La Bañesamündet er in den Río Tuerto, der seinerseits nur etwa zweieinhalb Kilometer weiter südöstlich in den Río Órbigo mündet.
Vor allem der Oberlauf des Flusses ist landschaftlich durchaus reizvoll und bei Anglern beliebt; die Gemeinden und Dörfer an seinen Ufern bieten Ferienwohnungen (casas rurales) zur Vermietung an. Viele Dörfer der Comarca Maragatería haben noch altes Straßenpflaster sowie aus Bruchsteinen gemauerte Häuser und Kirchen.