Die Hauptstadt und größte Stadt Atlántidas ist die HafenstadtLa Ceiba. Die zweitgrößte Stadt ist Tela. Die fünf nächstgrößten Dorfgemeinschaften sind La Masica, Arizona, El Porvenir, Esparta und Santa Ana, die sich zu einer Mancomunidad zusammengeschlossen haben. Wirtschaftlich hängt die Region vom Ananas-Anbau und von der Afrikanischen Palme, deren Früchte zu Öl verarbeitet werden, ab.
Municipios
Verwaltungstechnisch ist das Departamento Atlántida in acht Municipios unterteilt: