Deborah Nunes gehörte dem Kader der brasilianischen Mannschaft Metodista/São Bernardo an. Die Rückraumspielerin gewann mit Metodista 2012 die brasilianische Meisterschaft.[2] Ein Jahr später reichte es für Metodista lediglich zum Vizemeistertitel.[3] Ab Beginn der Saison 2019/20 stand sie beim russischen Erstligisten GK Astrachanotschka unter Vertrag.[4] Als Nunes im März 2020 nach einem Auslandsaufenthalt gegen Quarantänevorschriften der COVID-19-Pandemie verstieß, wurde ihr Spielervertrag gekündigt.[5] In der Saison 2021/22 stand sie beim spanischen Erstligisten CB Atlético Guardés unter Vertrag.[6][7]
Deborah Nunes lief anfangs für die brasilianische Juniorinnen-Nationalmannschaft auf und wurde anschließend in den Kader der A-Nationalmannschaft aufgenommen. Mit der brasilianischen Auswahl nahm sie im Sommer 2013 an der Panamerikameisterschaft teil, bei der Brasilien den Titel gewann.[8] Im Dezember desselben Jahres lief sie für ihr Land bei der Weltmeisterschaft in Serbien auf. Dort erzielte Nunes elf Tore in neun Begegnungen und errang den WM-Titel.[9]