Von 1995 bis 2000 war Călin Ioan Bot als Ausbildungsdirektor an der Theologischen Fakultät St. Johannes Evangelist tätig. 2003 absolvierte er an der Päpstlichen Universität Gregoriana in Rom einen Kurs für Ausbilder in Priesterseminaren. 2005 erwarb Bot an der gleichen Universität ein Lizenziat im Fach Spiritualität. Von 2005 bis 2017 war Călin Ioan Bot Regens des Theologischen Seminars St. Johannes Evangelist in Cluj-Napoca. 2017 wurde Bot zum Protosynkellos der Eparchie Cluj-Gherla berufen.
Am 15. Juni 2023 wurde seine Ernennung zum Bischof von Lugoj bekanntgegeben, die Großerzbischof Lucian Kardinal Mureșan im Einvernehmen mit der rumänischen griechisch-katholischen Synode und nach Information des Heiligen Stuhls zuvor verfügt hatte.[2] Die Amtseinführung fand am 20. Juli desselben Jahres statt.