Als er elf Jahre alt war, tötete sein Vater, ein angesehener Arzt und Chirurg, seine Mutter und sich selbst mit einer Feuerwaffe. Aiken wurde anschließend von seiner Großtante zweiten Grades in Massachusetts aufgezogen.
Insbesondere seine frühen Geschichten waren stark beeinflusst durch den Symbolismus. 1930 gewann Conrad Aiken den Pulitzer-Preis für Poesie für seine Ausgewählten Gedichte, Selected Poems. Er schrieb die oft in Anthologien verwendete Kurzgeschichte Silent Snow, Secret Snow (1934). Zu seiner Sammlung von Gedichten gehören Earth Triumphant (1914), The Charnel Rose (1918) und And In the Hanging Gardens (1933).
Der Grabstein von Aiken auf dem Bonaventure Friedhof am Flussufer des Savannah wurde berühmt, nachdem er in dem Bestseller Midnight in the Garden of Good and Evil von John Berendt erwähnt wurde. Einer örtlichen Legende zufolge wünschte sich Aiken einen Grabstein in Form einer Bank als Einladung für Besucher, anzuhalten und einen Madeirawein zu trinken. Die Inschrift lautet: Give my love to the world (Gebt der Welt meine Liebe) und Cosmos Mariner – Destination Unknown (Kosmos Seemann – Ziel unbekannt).
Conrad Aiken ist der Vater der Schriftstellerin Joan Aiken.
