Die Gemeinde befindet sich südlich des Genfersees und am linken Ufer der Seymaz. Das Gemeindegebiet ist östlich von Thônex umschlossen, westlich, am anderen Ufer der Seymaz, liegt Chêne-Bougeries.
Geschichte
Der Weiler Chêne ist 1270 als Quercus erwähnt. Bis zum Vertrag von Turin 1754 war Chêne-Bourg Teil von Chêne (heute: Chêne-Bougeries). Danach ging das linke Ufer an Savoyen, während das rechte Ufer beim Kanton Genf blieb und der Ort damit zweigeteilt wurde. Die Gemeinde kam zusammen mit Thônex, dessen Teil sie geworden war, 1792 zu Frankreich und 1816 schliesslich wieder zum Kanton Genf. 1869 wurde Chêne-Bourg nach der Trennung von Thônex eine eigenständige Gemeinde.