Der CAF Cup 2001 war die 10. Spielzeit des drittwichtigsten afrikanischen Wettbewerbs für Vereinsmannschaften im Fußball unter dieser Bezeichnung. Die Saison begann mit der ersten Runde am 31. März 2001 und endete mit den Finalspielen im November 2001. Titelverteidiger war der algerische Verein JS Kabylie.
Sieger wurde zum zweiten Mal in Folge JS Kabylie aus Algerien, die sich im Finale nach einem Gesamtergebnis von 2:2 aufgrund der Auswärtstorregel gegen Étoile Sportive du Sahel durchsetzen konnten.
Da sich Simba FC vor dem Hinspiel aus dem Wettbewerb zurückzog, rückte Katsina United FC automatisch in die nächste Runde.
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Das Hinspiel wurde beim Stand von 3:0 abgebrochen. Im Anschluss wurde Deportivo Mongomo disqualifiziert, da diese zu spät zum Spiel erschienen und somit den Anstoß verzögerten. SM Sanga Balende rückte deshalb automatisch in die nächste Runde.