Die Anstalt ist in einen Bereich für Schwerverbrecher und einen Bereich für den normalen Strafvollzug unterteilt. In der Klassifikation des US-amerikanischen Gefängnissystems wurde das Gefängnis als „Maximum Security Prison“ eingestuft. 2005 wurde es auf „Medium Security Prison“ abgestuft[1]. Betrieben wird die Strafvollzugseinrichtung vom Federal Bureau of Prisons, der Strafvollzugsbehörde der amerikanischen Bundesregierung.
Die Anstalt unterhält einen sogenannten UNICOR-Betrieb (den größten der USA), wobei die arbeitenden Insassen in der Textil-, Möbel- und Druckproduktion eingesetzt werden. Es ist mit bis zu 2.100 Insassen belegt. Das Bundesgefängnis liegt in der Nähe der United States Disciplinary Barracks, der Midwest Joint Regional Correctional Facility und der Lansing Correctional Facility. Diese vier bedeutenden Strafanstalten stellen einen wichtigen Wirtschaftsfaktor in der Gegend um Leavenworth dar.