Für die Präsidentschaftskampagne von Hillary Clinton2007/2008 war er Chefberater für Wirtschaftspolitik. Nachdem Clinton ihre Kampagne zu Gunsten von Barack Obama beendet hatte, begleitete Deese fortan Obamas Wahlkampf als wirtschaftspolitischer Berater. Nach dessen Wahl zum US-Präsidenten war Deese Teil des Übergangsteams, um Obamas Amtsübernahme vorzubereiten und anschließend als Senior Advisor für ihn tätig. In der Obama-Regierung diente Deese als stellvertretender Direktor des Office of Management and Budget und war der amtierende Direktor des Büros im Sommer 2014.[2] Deese diente auch als stellvertretender Direktor des National Economic Council.
Anschließend war Deese als Global Head of Sustainable Investing bei BlackRock tätig. Er wurde im Jahr 2021 von Präsident Joe Biden zum Direktor des National Economic Council ernannt.[3]