Das Label wurde 1975 von Giacomo Pelliciotti gegründet. Er gab damit insbesondere Musikern des Avantgarde Jazz Gelegenheit, Platten aufzunehmen. 1977 übernahm Giovanni Bonandrini die Leitung des Labels.[1] 1979 wurde zudem ein weiteres Label namens Soul Note gegründet.
Das Label Soul Note war zunächst Musikern vorbehalten, die näher am "Mainstream" des Jazz orientiert sind, auch wenn die musikalischen Übergänge zwischen den beiden Labels fließend sind. Heute finden sich aber auch Platten von Tony Oxley oder Bill Dixon auf Soul Note.
Sitz der Plattenfirma ist in Tribiano, Italien. Viele der Black Saint-Aufnahmen wurden in Mailand eingespielt, meist anlässlich von Tourneen der Musiker durch Europa, manchmal auch in Begleitung durch italienische Musiker wie Giorgio Gaslini, der ebenso für das Label aufgenommen hat. Inzwischen leitet Giovanni Bonandrinis Sohn Flavio die Geschäfte.
2008 wurde sowohl Black Saint als auch Soul Note von der KEPACH Music Group übernommen. Zu dieser Gruppe gehören ebenfalls CAM Jazz, CAM Jazz Presents und Dischi Della Quercia.[2]