Das Bistum Tacna y Moquegua wurde am 18. Dezember 1944 aus Gebietsabtretungen des Erzbistums Arequipa als Bistum Tacna errichtet. Es wurde dem Erzbistum Arequipa als Suffraganbistum unterstellt. Am 11. Juli 1992 wurde der Name des Bistums Tacna in Bistum Tacna y Moquegua geändert.