Jørgensen studierte an der Dänischen Theaterschule. Seit 1993 ist sie als Schauspielerin für Bühne, Film und Fernsehen tätig. Die erste Hauptrolle hatte sie 1993 in dem SpielfilmSidste omgang des dänischen Regisseurs Thomas Vinterberg. 2001 wurde sie auf dem Robert-Festival in Kopenhagen mit dem Preis als beste Nebendarstellerin sowie dem European Shooting Star geehrt; 2002 erhielt sie den Lauritzen-Preis, 2004 gewann sie auf dem Internationalen Frauenfestival in Bordeaux den Zuschauerpreis für ihre Rolle in In deinen Händen.
Jørgensen war von 1991 bis 1999 mit dem Regisseur Emmett Feigenberg (* 1954) verheiratet. Aus der Ehe gingen ein Sohn und eine Tochter hervor, die Schauspielerin Carla Feigenberg.