Die Inseln haben keine hohen Berge, sind aber sehr hügelig, vier Gipfel ragen über 500 m auf. Die Einheimischen betreiben auf den Hügeln mit bemerkenswertem Erfolg Terrassenfelder.
Eine Anzahl der hingerichteten Führer des Shimabara-Aufstandes in der ersten Hälfte des 17. Jahrhunderts wurden auf dieser Insel beerdigt.
In Amakusa liegen die größten Kaolinvorkommen Japans, der Anteil der Fördermenge liegt bei 80 % der Gesamtproduktion Japans. Das Amakusa-Kaolin wird von vielen namhaften Porzellanherstellern Japans verwendet und historisch[1] von den Töpfern von Satsuma (Satsuma-Porzellan) und Hirado.