Als Teenager gründete Johannes zusammen mit Hillel Slovak, Jack Irons und Todd Strassman (später ersetzt durch Michael „Flea“ Balzary) die Band Anthym, welche später in What Is This? umbenannt wurde. Die Band löste sich Mitte der 80er Jahre auf, nachdem Slovak und Irons sich den Red Hot Chili Peppers anschlossen.
Ende der 1980er lernte Johannes seine spätere Lebensgefährtin und Bandkollegin Natasha Shneider kennen und veröffentlichte zusammen mit ihr 1987 ihr erstes gemeinsames Werk namens Walk the Moon.
1990 gründeten Johannes, Shneider und Irons die Band Eleven, welche eines von Johannes umfangreicheren und längerfristigen Projekten werden sollte und erst 2008 nach dem Tod von Shneider aufgelöst wurde.[1]
Mitte der 90er begann Johannes verstärkt, an Projekten befreundeter Musiker mitzuwirken, unter anderem bei Chris Cornell und UNKLE.
Im Jahr 2000 wirkte Johannes bei dem zweiten Album der Band Queens of the Stone Age mit und hatte dadurch viele Kontakte zu Josh Homme und seinen Bandkollegen gesammelt und wurde daraufhin in fast alle Nebenprojekte Hommes mit einbezogen.
So wirkte Johannes bei den Desert Sessions 7&8, sowie 9&10 mit, hatte Gastauftritte auf Queens of the Stone Ages Alben Songs for the Deaf und Lullabies to Paralyze und spielte auf der anschließenden Tour 2005 bis 2006 Gitarre und Bass. Auch in Hommes Nebenprojekten Eagles of Death Metal und Them Crooked Vultures ist Johannes sowohl als Musiker, als auch als Produzent tätig gewesen, ehe er mit letzterer 2009 bis 2010 auf Tour ging. Auch bei diversen Alben von Mark Lanegan ist Johannes zu hören. Seine letzten Werke sind unter anderem die mit der Band Spinnerette entstandenen sowie sein 2010 veröffentlichtes Soloalbum Spark, welches er seiner 2008 verstorbenen Lebensgefährtin Natasha Shneider widmete und komplett allein einspielte.
Im Laufe seiner Karriere hat Johannes mit einer Vielzahl von Künstlern und Bands verschiedener Genres zusammengearbeitet. Neben diversen Instrumenten betätigte er sich ebenfalls als Toningenieur, Mixer und Produzent.