Sophie Amalie Ahlefeldt (12. juni 1675, København – 24. december 1741) var en dansk adelskvinde, der var datter af storkansler Frederik Ahlefeldt (1623-1686) i hans ægteskab med grevinde Maria Elisabeth af Leiningen-Dagsburg-Hardenburg (1648-1724). Hun var hertuginde af Slesvig-Holsten-Sønderborg-Augustenborg fra 1701 til 1714 som ægtefælle til Hertug Frederik Vilhelm af Slesvig-Holsten-Sønderborg-Augustenborg.
Sophie Amalie giftede sig den 27. november 1694 i Hamburg med Hertug Frederik Vilhelm af Slesvig-Holsten-Sønderborg-Augustenborg (1668-1714), yngste søn af Hertug Ernst Günther 1. af Slesvig-Holsten-Sønderborg-Augustenborg (1609-1689) i hans ægtskab med prinsesse Augusta af Slesvig-Holsten-Sønderborg-Glücksborg (1633-1701). I ægteskabet blev der født fem børn: