Han begyndte at træne aikido i 1946 under aikidoens grundlægger Morihei Ueshiba i Iwama, og var der til Ueshibas død i 1969.
Derefter fik han ansvaret for træningen i dojoen i Iwama og for pasning af Aiki Jinja, en med aikido forbundet shinto-helligdom.
Saito var medlem af Aikikai, den største aikidoorganisation, men hans stil var så enestående, at mange omtalte den som en særskilt stilart, Iwama Ryu. Han systematiserede våbentræningen i aikido (aiki-ken og aiki-jo) og var forfatter til en lang række bøger om aikido. Morihiro Saito døde af kræft d. 13. maj 2002.
Bøger
Aikido – Its Heart and Appearance (Wehman Brothers 1976) ISBN0-87040-345-1