Stidsen var 1997-2000 adjunkt på Institut for Nordisk Filologi på Københavns Universitet. I 2000 blev hun lektor på Institut for Nordiske Studier og Sprogvidenskab sammesteds. 2015 blev hun dr.phil.[3] I 2021 opsagde hun sin stilling som lektor, efter at hun var blevet beskyldt for plagiat i to af sine værker.[1][4][5] Praksisudvalget på Københavns Universitet frikendte i oktober 2022 Stidsen for anklagerne om plagiat.[6][7][8][9]