Instituttet består af de fem akademier, et bureau, der fungerer som bestyrelse samt en administrativ enhed. Bureauet ledes af en præsident og en kansler. Kanslerembedet blev etableret i 1952, og siden 2005 har pris Gabriel de Broglie beklædt posten. Administrationen ledes af en præsident, der vælges for et år. Medlemmerne af instituttet er de samme som i akademierne.